在人与妖怪之间过着忙碌日子的夏目，偶然与以前的同学结城重逢，由此回忆起了被妖怪缠身的苦涩记忆。此时，夏目认识了在归还名字的妖怪记忆中出现的女性津村容莉枝。和玲子相识的她，现在和独子椋雄一同过着平稳的生活。夏目通过与他们的交流，心境也变得平和。但这对母子居住的城镇，却似乎潜伏着神秘的妖怪。在调查此事归来后，寄生于猫咪老师身体的“妖之种”，在藤原家的庭院中，一夜之间就长成树结出果实。而吃掉了与自己形状相似果实的猫咪老师，竟然分裂成了3个。

　有一天，主人公黑羽快斗得知8年前失踪的父亲——黑羽盗一就是怪盗基德，父亲的失踪与一个神秘组织有关。为了揭开父亲的死因，黑羽快斗决定继承父亲怪盗的职业和名字，成为了第二代怪盗基德，不顾生命危险，想引出杀害父亲的凶手。

是以TV版提取出的剧场版，其中第一集《鲁邦三世的婚姻》，女富翁丽贝卡·罗塞里尼是第四季的主要角色，而MI-6的尼克斯则为首次出现。以及第三集中「生存率0.2％」提取出情节给未看过电视剧的观众，并添加原创新故事：一个自称是伯爵的面具原创角色，和鲁邦三世的“卡格里斯托伯爵的遗产”的心理争夺战。

国际刑警的钱形幸一警部收到了鲁邦三世从圣马力诺共和国发来的婚礼邀请函，不过结婚对象不是峰不二子，而是一位叫丽贝卡·罗塞里尼的圣马力诺女财阀，身兼时尚模特、女演员等多个职务，她还以「八卦女王」的身份与许多名人有过艳闻。身世背景和不二子一样是个谜……

少年时代，南波兄弟意外在夜空中目击了那如梦如幻的UFO，这次经历在他们幼小的心中埋下了航空梦的种子，他们相约朝着宇航员的目标努力，携手登上月球表面。此去经年，南波日日人率先实现了兄弟俩的梦想，另一方面，日日人的哥哥南波六太正走着一条全然不同的道路。他少言寡语，全无干劲，而就在他最低落的时刻，一个久违的词汇突然在他的脑海中浮现。