本片讲述了在香港的一幢写字楼里发生的三个鬼故事： 第一单元：最后一格： 阿潘（莫文蔚饰）刚到这幢楼的一家证券公司工作，发现女同事都不用厕所的最后一个格，因为那里“不干净”，阿潘刚开始不明白其中含义，后来听说今年先后有两名女子用此厕格后离奇自杀死去，而每年都会有三个人因为在使用过这个后厕格自杀而死，今年的第三个自杀者究竟是谁呢...... 第二单元：选择： Ken（冯德伦饰）第一天到玩具公司上班，在大堂看见白衣女子和红衣女子（舒淇饰），红衣女子长得比白衣女子美丽得多。红衣女子告诉他自己有阴阳眼，白衣女子是鬼，还逼她跳楼...... 第三单元：准时上班： 在公司服务了45年的Mary姐（罗兰饰）到了年底就可退休回乡养老，老板之子（陈小春饰）为了省却这笔可观的退休金，想法子辞退她......

1991年，香港黑帮龙头倪坤被杀，倪氏家族旗下五大头目中除韩琛（曾志伟）外，均伺机背叛发难，不料却被倪家不起眼的第二代倪永孝（吴镇宇）不费一兵一卒牵制，此举引来重案祖督察黄志诚（黄秋生）的戒心，使其派出警校学生陈永仁（余文乐）渗入倪家进行长期的卧底工作，而韩琛为了巩固势力，早在警察内部安插了线人刘建明（陈冠希）。三年后，事业蒸蒸日上的倪永孝为安枕无忧，决意将五大头目一举歼灭，却因疏忽让韩琛成为漏网之鱼。 1997年，大难不死的韩琛重出江湖，为替死去的同事报仇，黄志诚找到他商议合作除掉倪永孝的事宜，不久却发现此举铸成大错，而各自为自己的尴尬身份苦恼的陈永仁和刘建明，则在无间道的路上越行越远。

進入二十一世紀，飛虎隊在頭目Stone的帶領下，面對內憂外患，首先，一群舊人已經老化，部分老隊員更不是退役，便是轉職。其次，飛虎隊進入新舊交替的時期，投考人數減少，警方高層希望Stone降低標准，但Stone當然拒絕，因這可能要隊員賠上性命。新加入的隊員和Stone有隔閡，有人因飛虎只是一味操練而不是對付罪犯，怀疑當飛虎的意義。飛虎要因應時世的改變而進行新的培訓，以防有一天要對付恐怖分子及擁有現代化犀利槍械和軍火的罪犯。新的隊員一時間未能适應。另一方面，當局對Stone亦不太信任，畢竟他是個英語說得比中文好的隊長，再加上經濟不景，飛虎所得的資源只減無增。凡此种种，都令Stone充滿煩惱，飛虎隊可說是面對要証明本身是最現代化的精英部隊的种种挑戰。 王季一伙罪犯，來自五湖四海，包括泰國，菲律賓，越南，相同的是他們過去?都從軍隊中學回來不少軍事常識，王季通過一名本港線人給予警方假線報，重案組警探耶穌得此假線報，通知其好友兼上司韓堅，說有批軍火已呷胂愀郏w虎隊奉命出動捉拿匪徒，結果扑了個空，只搗破一個翻版中心。王季一伙則偷偷的錄影了飛虎隊整個行動過程，以備日後造案時遇上飛虎隊，知道如何對付。 是次行動無功而還，耶穌十分無癮。他決定去考飛虎隊，但仍會將功補過，繼續追查這宗案件。

因忍受不了男友Moses（任贤齐）的平凡，阿Mi狠心与他分手，塞翁失马焉知祸福，Moses在老人院做义工时，与怪脾气老头蛤蚧王成为忘年之交，后者死后，给他留下巨额遗产。蛤蚧王的此举招致其律师Allen的不满，他在夜总会发泄时无意中将此事告诉了小姐Didi（张柏芝）。 为将Moses钓到手，Didi使出浑身解数，无奈均不奏效。发现Moses是绝种好男人后，Didi对他动了真心，两人开始热恋，不久，Allen将Didi的原来身份相告Moses，令他异常伤心，此时，阿Mi又前来要与他复合。