故事延续《终极一班2》结尾中，被改变的金时空未来接续开始。 由于金时空的未来已被雷婷和中万钧改变，因此在本剧中，战力指数和K.O榜也回归。呼延觉罗·修告诉汪大东灸舞盟主新下的指令，要汪大东调查金时空最近战力指数异常飙高的现象， 所有线索都指向芭乐高中，所以盟主传汪大东回去调查的原因，虽然汪大东已经28岁了而且也不想回芭乐高中， 但是汪大东高中并没有毕业，也没有反对盟主的权利，所以只好回芭乐高中继续就学。新的故事也要展开了……

铁时空的大战仍未止息，为了保护雷婷，大东委托东城卫首席战斗团团长修带着她先行回到金时空，自己与夏天并肩作战对抗魔界大军，雷婷万般不舍地离开大东。没想到修和雷婷在回金时空的路上却意外遇伏击分散，雷婷失踪！ 而此时终极一班群龙无首，辜战与止戈两兄弟为了当老大展开比武对决。修找到了终极一班，雷婷失踪引发了轩然大波，经过众人努力终于找到雷婷，让她重回老大位置。却发现她性情大变，原来这一切都是一场骗局……

隋唐时期康城御史大夫的女儿步萌，进宫后为了躲避宫廷是非，也不愿意自己的姻缘命运被他人安排左右，一辈子依附皇权过日子，一直都装病躲避侍寝。在后宫中相继认识了聪明伶俐的言轻言妃、爱哭爱吃爱皇上的曲嫔，以及武功高强出自将门的骁贵人。几个人性情相投，成为至交好友。皇上因步御史多次批评谏言，决定找步御史的女儿步萌出气，但随着与步萌越来越多的接触反被她与众不同的个性所吸引，开始有意无意的制造接触机会。但是步萌避之唯恐不及，直到一次偶然的微服出宫，两人成为了朋友，步萌也逐渐发现了皇上身上的很多优点，也深深的爱上了皇上，决定为了爱情放弃自己的执念。