封号南拳王的洪拳武术家暴毙于隧道中的自家车上，尸体并没刀伤或枪伤痕迹，初步监定死于重拳，重案组总督察陆玄心（杨采妮 饰）负责调查，对死因感到不解；此时却收到监狱传来消息，犯了误杀罪的服刑犯人夏侯武（甄子丹 饰），主动表示愿意协助警方调查，条件是即时假释。 “先练拳次练腿，后擒拿用兵器，由内而外”，夏侯武断言凶手行凶目的并非寻仇，且会继续犯案。果然，号称北腿王、擒拿王、兵器王的武术界精英相继遇害，均死于各自成名的武功之下。得到夏侯武提供线索，以及现场遗下的仿古暗器“堂前燕”，陆玄心终于发现凶手藏身之所，这时夏侯武却违反假释令突然失踪。 两个武艺超凡的杀人犯同时在逃，他们是敌是友？两雄相遇，一场巅峰对决势所难免。

闻名赌坛的“魔术手”石一坚（周润发 饰）在参加好友龙叔（姜大卫 饰）的海上生日派对时，突遭来路不明的女杀手伏击，后得知她们受旧敌D.O.A组织派来灭口，而她们的目标不仅是杀死石一坚，更要捉拿携组织一百五十亿美元资金潜逃的会计小马（张家辉 饰）。 为保护小马及粉碎D.O.A的阴谋，石一坚与徒弟Vincent（余文乐 饰）前往泰国，结果与小马及其女儿初一（王诗龄 饰）结成患难拍档，并经历一连串奇遇；期间，石一坚还与旧情人莫愁（刘嘉玲 饰）重逢，两人再续前缘。但让众人始料未及的是，这时D.O.A已布下了一个更大的圈套……

　　展灏——大宋朝一员功勋彪炳的边关将军，爱国爱民，从未想到有一天，自己战场杀敌的刀，必须拿来杀戮自己的百姓，只为了花尽国库银的昏君意欲抢夺一座铁矿山，好就近开采冶炼以应军需之急。 三道密旨的催逼下，展灏不得不奉命屠了不肯让出铁矿山的赵家村，展灏即将临盆的妻子赶去阻止却被误杀，临死前产下一子，为县令方子庵所救，取名方旭，视若己出的抚养成人。而展灏却因方子庵拿着万民陈情书上京告御状，屠村惨案在朝野中闹得沸沸扬扬，不得不做了皇帝的替罪羊，以叛国罪入狱，展氏一族满门抄斩。侥幸逃出生天的展灏闯入太子宫中，带走即将弥耳的长皇孙，取名余火莲，从此立誓必以皇室血脉之手，推翻大宋朝廷。 二十年后，太子仁宗即位，余火莲一举夺下开状元功名，入朝为官，并与如今已贵为御史中丞的方子庵之女方离相识相恋。而方旭亦在子庵教养下，长成为坦荡磊落，嫉恶如仇之人，在帮助父亲查案过程中，与京师第一青楼“御香斋”的红姑娘李柏化敌为友，进而相亲相爱。　　火莲与方旭武艺相当，性情相投，又因方离之故成为惺惺相惜的好友。与此同时，朝官被害的案件不断发生，在新任开封府尹包拯调查下，箭头终于指向一个神秘的民间叛乱组织“无间道”及贼首“幽冥王”。方旭奉皇命假作弑父，亡命天涯被“无间道”收容。逐步打入组织核心，但也因此而受尽委屈，与李柏的恋情更是一波三折，饱受考验。 火莲一心抱着颠覆宋朝的使命而来，却发现仁宗、子庵、包拯等人并不是想象中的那么残暴，但父命难违，火莲时时扎于矛盾痛苦之中，幸赖方离的坚强与支持，方能度过重重心理难关。 方旭日渐为幽冥王赏识重用，狂放的火莲亦受到仁宗的欣赏及包容，两对父子在互不知血缘之亲的情况下，走过一路相互较劲的恩怨风雨。 最终在包拯及方旭查证下，真相大白，幽冥王即为当年的大将军展灏，亦是方旭之亲生父亲。方旭虽得认祖归宗，更名展昭，但展灏却为了让追随自己的千万手下能死心散去，解甲归田，无怨无悔的选择了自尽身亡。 火莲虽贵为太子，但仁宗为了朝廷国家，不能暴露当年先皇罪行，亦不能让火莲回到宫中，展氏一族横亘二十年的冤屈虽得昭雪，但许多遗憾却已无法弥补……

在韩沉锲而不舍的追查下，他发现白锦曦居然就是自己一直苦苦找的未婚妻苏眠！两人的意外失忆涉及到五年前一个连环杀手组织所犯下的案件。这个连环杀手组织的成员均由字母做代号，他们行事诡谲，享受杀人的乐趣，在被警方取缔时制造了爆炸，从而掳走苏眠并伪造她的身份令她活了下来。而之后两人所经历的案件，竟然都与这个字母杀手组织有着千丝万缕的关系。正义与邪恶的对决一触即发！当韩沉和苏眠一点一点找回记忆，打算携手对抗字母杀手组织时，他们发现，字母组织的那些变态杀手们早已渗透到了他们的身边……

神秘的字母杀手组织逐渐浮出水面……在韩沉和苏眠锲而不舍的追踪下，字母团出人意料的主动出击，发出一封宣告信！一时间城市内危机四伏，广场炸弹背心案、化工厂系统失控伤亡事件、植物园人形雕塑毒杀案，种种案件接踵而来。字母杀手组织似乎在编制着一张大网，悄无声息的将韩沉和苏眠引到陷阱中来。正义与邪恶的对决一触即发，韩沉和苏眠携手对抗字母杀手组织，与此同时也一点一点找回记忆，终于一一查明字母杀手们的身份。而没想到的是，杀手组织的首领S，居然就是一直在苏眠身边的好友徐司白！原来苏眠的父亲正是死于徐司白的父亲之手，徐司白暗中窥视苏眠多年，早已情根深种。五年前，字母杀手组织策划了一起惊天大案，以与苏眠长相相似的表妹白锦曦代替苏眠死去，而苏眠则成了白锦曦，更策划让韩沉、苏眠以及徐司白共同失忆，只为让徐司白以新的身份陪在苏眠身边！警方正式开始抓捕字母杀手组织，双方经历大战，最终正义取得了胜利，黑盾组众人都得到了圆满结局。案件终结后，黑盾组相约小聚，不远处却有人留下了一幅画像，画像上的人正是苏眠，而落款是S。