真历71年,总人口的70%均居住在宇宙的时代,此时的世界并存着两大势力——由军事同盟发展而来的"多尔希亚军事盟约连邦"与因贸易协定而扩大的"环大西洋合众国(ARUS)".而故事的主角时缟晴人所在的中立小国迪欧尔也遭到了多尔希亚军的侵略,当平稳的日常失去时,时缟晴人与神秘的人型兵器"Valvrave"相遇了…

昔日孩童时期总是一起结伴同玩的6位好朋友，在察觉到的时候，他们的关系便因各自升上了高中而疏离了。但某一天，虽然各种事物都在变化，但唯独她不变的女主角·本间芽衣子却突然出现在已像隐蔽青年般的主人公·宿海仁太面前，虽然芽衣子说她要让仁太帮她达成愿望，但当仁太也去了解她的愿望时，却发现她的愿望只是想把昔日要好的儿时玩伴再次聚集。 现在各散东西的玩伴还有散发着辣妹气息的安城鸣子、进入了以大学为目标的学校的松雪集和鹤见知利子、以及在高中便放弃升学现正四处游历的久川铁道。《那朵花》的故事不禁使人想起昔日很要好的朋友，现在到底在哪里呢？若我们再次遇见，已各自生活在各个领域的大家又能否像以往般的要好？

由于家境困难而开始在家庭餐厅打工的东田大辅。但，那里却是有着料理白痴的外场主管、一切都以金钱衡量的服务员等等，没什么正经人的家庭餐厅……！？

20XX年，日本正处于严重的巨额财政赤字，日本的经济可谓已经崩坏了，正处于末期的危机当中。但是，一个叫“Sovereign Wealth Fund”的政府系金融机构却出现了，凭着成功地运用政府的资金，使政府能够奇迹地实现财政的重建。但另一方面，虽然日本经济能够走出谷底，但在这回复期间，长期的就职问题，失业、自暴自弃者引发的无差别杀人事件，因结婚率的减少导致少子化而感到绝望的人，逃避现实的人，失踪者及自杀者都急剧增加中……简单来说，当时的气氛使人感到非常不安及担忧。而就在某一天，就读都内的经济学部的大学生主人公・余贺公麿，在他面前出现了一位奇怪的男子真板木，并询问公麿“如果抵押你的未来，借给你金钱，你又将如何利用自身的才智去使用这笔钱？”。就这样，公麿的世界便从这天起大大地转变了。

在新生ALO中，桐人、亚丝娜和结衣谈到了鲸鱼，从没有见过鲸鱼的结衣对鲸鱼非常感兴趣，为了帮助结衣桐人想到了新生ALO中海边的任务。不料直叶却不会游泳，为了能正常进行海边的任务大家决定对直叶进行游泳特训。与此同时，桐人被菊冈诚二郎以“心理咨询”的名义骗至心理咨询室，并从桐人处详细调查了“SAO”和“ALO”等事件。桐人离开菊冈诚二郎处后登入新生ALO与大家一起进行了“深海掠夺者”的任务，最终返回时结衣如愿以偿地见到了鲸鱼。后桐人再次接到了菊冈诚二郎的电话。（打算委托桐人调查“GGO”，此时剧情进入“幽灵子弹篇”）