剑悟变成特利迦奥特曼，为了守护大家的笑容，在永恒核心里消失了。时间推进到特利迦消失的两年后，时冈代理队长率领精英胜利队想方设法复活在永恒核心中消失的真中剑悟。在众人的不懈努力下，终于复活了剑悟。剑悟复活后取回了特利迦的力量，结果在面对新的怪兽时，陷入了苦战。就在特利迦难以招架的时候，泽塔奥特曼跨越宇宙次元，再次来到地球前来帮助特利迦。没想到随着事情的发展，遥辉发现了事情的背后居然浮现出了宿敌赛雷布洛的影子。于是，遥辉开始追查赛雷布洛的踪迹。三千万年前超古代人的残党，他与赛雷布洛联手，试图获取剑悟的光之力量。他可以变身成邪恶特利迦，实力非常强大。特利迦根本招架不住邪恶特利迦，不光泽塔前来帮助特利迦，就连伊格尼斯也变成黑暗特利迦前来协助特利迦。三位战士将联手粉碎超古代人残党与赛雷布洛的阴谋。

剑悟变成特利迦奥特曼，为了守护大家的笑容，在永恒核心里消失了。时间推进到特利迦消失的两年后，时冈代理队长率领精英胜利队想方设法复活在永恒核心中消失的真中剑悟。在众人的不懈努力下，终于复活了剑悟。剑悟复活后取回了特利迦的力量，结果在面对新的怪兽时，陷入了苦战。就在特利迦难以招架的时候，泽塔奥特曼跨越宇宙次元，再次来到地球前来帮助特利迦。没想到随着事情的发展，遥辉发现了事情的背后居然浮现出了宿敌赛雷布洛的影子。于是，遥辉开始追查赛雷布洛的踪迹。三千万年前超古代人的残党，他与赛雷布洛联手，试图获取剑悟的光之力量。他可以变身成邪恶特利迦，实力非常强大。特利迦根本招架不住邪恶特利迦，不光泽塔前来帮助特利迦，就连伊格尼斯也变成黑暗特利迦前来协助特利迦。三位战士将联手粉碎超古代人残党与赛雷布洛的阴谋。

野上爱理和野上良太郎两姐弟正在准备重新开咖啡店——牛奶北斗。此时，桃塔罗斯突然出现在了良太郎的面前。因为遭到了异魔神的入侵，时间列车电王号出现了失控的情况。与此同时，外出采购食材的爱理被两个小混混缠上了。千钧一发之时，桃塔罗斯附身了良太郎，及时赶去救下了爱理。良太郎与桃塔罗斯从小混混的口中得知，有人刻意指使他们来袭击爱理。大家环顾四周，意外地发现了樱井侑斗的身影……爱理回到店里准备开业，又出现了几个恶棍冲进店里闹事，但这一次阻止了恶棍们的人，居然是侑斗。为什么侑斗会及时出现帮爱理？盯上爱理的幕后黑手到底是谁？时间列车电王号仍在失控乱窜，爱理也遭到了异魔神的攻击，可以说是一波未平一波又起。为了守护家人，守护时间，侑斗与良太郎一起追查真相，直面一个又一个危机。

负塔罗斯军团联手牙鬼族袭击了银行，还偷走了电王的通行证，妄图统治全世界。为了打倒恶徒，时间列车分局成立了，桃塔罗斯等人干劲十足地开始了调查。警视厅派来了铃木刑警负责此案，铃木是个很胆小的警察，让良太郎他们哭笑不得，但又不得不协助他的工作。铃木执着于立功，独自一人潜入负塔罗斯军团的秘密基地，不料中了圈套。前来救他的良太郎等人也不幸中了陷阱，但好在成功逃脱。而此时，负塔罗斯军团已经向国会议事堂发起了进攻。为了阻止他们，假面骑士电王与月骑强强联手，击败邪恶。

《剧场版 再见了假面骑士电王 最后的倒计时》为《假面骑士电王》的剧场版，2008年上映，故事描绘了假面骑士电王的最后一场战斗。桃塔罗斯一行人结束了与异魔神们的战斗，终于过上了悠闲的生活。但最近，街头巷尾盛传，出现了一辆神秘的幽灵列车。叶奈与桃塔罗斯等4位异魔神一起出发寻找，却遇上了遭到绑架的良太郎。在敌人凌厉的攻势下，前来帮忙的侑斗身受重伤。这时，新一任假面骑士电王搭乘着崭新的时空列车前来力挽狂澜！混战中，桃塔罗斯找到了机会和良太郎对话。于是，以良太郎所言——“保护象”和一张车票为线索，桃塔罗斯一行人坐上时间列车，驶向300年前的过去……究竟是谁绑架了良太郎又迫使他变身？又是谁在暗中策划扭转生死、篡改历史的阴谋？面对可怕的新敌人，良太郎与幸太郎携手，展开了最后的战斗。