巡之丘学园生活社成员的丈枪由纪，将与顾问老师佐仓惠、社长若狭悠里及随身带著圆锹的恵飞须泽胡桃一起度过乍看之下快乐无比的校园生活。但事实上学校早已被一群僵屍所包围，但由纪却犹如失忆般的活在正常生活的幻想之中。其馀成员们为了保护她，必须一边与渐渐进逼的僵屍及生活问题对抗，一边维持正常学生生活以避免刺激到由纪。一场在幻想与现实中交错的故事，一群少女身处在名为学园的孤岛上的艰困生活才正要开始……

某一天，太平洋的中心突然出现了一片新的大陆，后来人们称之为圣洲。圣洲有着与现今所知的人类世界完全不同的生态系统，全新的物种，各种奇妙的自然现象，珍惜的矿物，这片大陆代表着无尽的未知和财富，同时也隐藏着未知的危险。每年有95万人在圣洲中遇难。主角因又和阿零经营着一家奇怪的店铺——拾人馆，这个店铺的主要业务就是去圣洲中拯救遇到危险而无法逃离的探险家，而他们的冒险就伴随着一次次的救助活动展开……

这里是人与怪物共存的世界。狩猎怪物的人被称作猎人。在那个猎人世界的一角，有着与怪物结绊共生的「RIDER（骑手）」。骑手拥有能让怪物隐藏的力量觉醒的「绊石」，与结绊的怪物「伴兽」秘密的一起生活。「骑手」与「伴兽」们结绊的物语，现在开始！