零一没有结束——灭亡迅雷站，复活！哉亚公司的ＣＥＯ——里昂 亚克兰德，掳走了灭亡迅雷站的迅。 灭、亡还有雷想要去救迅，却看到了大量的“士兵型修码吉亚”。里昂的目的是大规模生产没有自我意识的“士兵型修码吉亚”，把他们当成武器，卖往全世界各国。 修码吉亚将被当成武器利用，迅对这一事实感到愤慨，并告诉灭他想解救这些修码吉亚。 于是灭亡迅雷站的四人，变身成了假面骑士，为救出“士兵型修码吉亚”而战斗。但就在那时，迅突然有些不对劲... 被里昂俘虏的迅到底经历了什么？一切都按照里昂的“计划”进行着，对人类而言的“最大威胁”， 将以令人意想不到的方式诞生——。

这是新时代骑士与人工智能的正面交锋。故事背景设定为迎来新时代的日本。引领人工智能潮流的公司——“飞电智能”，研发了一款AI机器人，并将其投入到实际运用中。它们完美融入了职场，把新时代朝着电子化的方向推进。但妄图灭绝人类的恐怖分子“灭亡迅雷站”黑了机器人的系统使之暴走。在这样的情况下，政府成立了专门针对AI犯罪的人工智能特务机关，来镇压暴走的AI机器人，维持治安。在一系列事件中，以成为搞笑艺人为目标的主角——飞电或人成了中心人物。在被炒鱿鱼的主人公面前出现了一辆无人驾驶的高档车，然后他突然间被告知，自己要继承飞电智能公司社长的宝座……

零一没有结束——灭亡迅雷站，复活！哉亚公司的ＣＥＯ——里昂 亚克兰德，掳走了灭亡迅雷站的迅。 灭、亡还有雷想要去救迅，却看到了大量的“士兵型修码吉亚”。里昂的目的是大规模生产没有自我意识的“士兵型修码吉亚”，把他们当成武器，卖往全世界各国。 修码吉亚将被当成武器利用，迅对这一事实感到愤慨，并告诉灭他想解救这些修码吉亚。 于是灭亡迅雷站的四人，变身成了假面骑士，为救出“士兵型修码吉亚”而战斗。但就在那时，迅突然有些不对劲... 被里昂俘虏的迅到底经历了什么？一切都按照里昂的“计划”进行着，对人类而言的“最大威胁”， 将以令人意想不到的方式诞生——。

"灭亡迅雷站的成员——亡正式登场了！本作揭晓了诸多谜团，亡的神秘身份，千骑系统的诞生过程，不破谏大脑中的芯片从何而来……为了打造千骑系统，天津垓指使亡去给灭亡迅雷站送密钥，与灭的接触以及天津垓对待属下的恶劣态度，让亡动摇不已。千骑诞生后，功不可破的亡却并没有得到好下场……"

时王，退幕之日；零一，诞生之日。绝对不可以交汇！2019年，世界已经被人工智能修码吉亚统治，身处不同世界的假面骑士零一和假面骑士时王奇迹般地相遇了。虽然他们都是为了拯救世界，但二人最终是会携手战斗还是相互为敌？父亲的梦想、儿子的梦想……当各自的想法发生碰撞之时，未来究竟会怎样…！？