大门真由（柴崎幸 饰）是北海道警钏路中央本部的新人刑警。为人较真不随和，被人称作“戴着剑道防具的女人”。真由没有母亲，唯一的亲人父亲史郎卧病在床将不久于人世，父亲以前也是个能干的刑警。片桐周平（泽村一树 饰）是真由的教育员，他新人时期曾接受史郎的熏陶。周平也知道真由成长的秘密。钏路雪原发现了身份不明的冷冻男尸，两人负责调查此案。从指纹发现该男子是曾在札幌有犯罪前科的加藤千吉。解剖发现体内有酒精跟安眠药。在加藤的档案上有史郎的签名，史郎说在札幌奥林匹克之前加藤当过人身买卖中介。真由和片桐认为此案可疑于是开始调查。而真相慢慢浮出水面……

巨大不明生物“祸威兽”不断地出现，已经成为日本习以为常的现象。这种生物通常兵器无力对抗，即将迎来极限的日本政府聚集了“祸威兽”专家，成立了“祸威兽特设对策室”通称“祸特对”。班长田村君男（西岛秀俊）、作战立案担当官神永新二（斋藤工）、非粒子物理学者滝明久（有冈大贵）、泛用生物学者船缘由美（早见明理)被选拔进入“祸特对”，执行任务。突然从大气外飞来的银色的巨人使危机加剧。为了处理银色巨人的问题，祸特对又新配置了分析官浅见弘子（长泽雅美）和神永携手处理。在浅见的报告书上这样写着——奥特曼（暂称），茫无头绪。

在实现世界性非武装化的2007年，如超古代文明人幽怜所预言:二大怪兽“哥尔赞”及“美尔巴”出现了。在怪兽攻击的目标——金字塔内，发现了三座巨大的石像。其中两座巨像被怪兽摧毁了。在这紧要关头，有着超古代人遗传因子，属于地球和平联合特搜队(TPC) GUTS分队的大古队员全身被光所包围，并融身于剩下的一座巨像内——迪迦奥特曼在“现代”复活了! 这部动画是为了纪念“奥特曼”诞生30周年而拍的新作。在这部作品中，迪迦和以往的“奥特曼”不同，为了对付强敌，可进行三种变身。此外，和“迪迦”一起担负保卫地球任务的 GUTS队员们，人人个性鲜明，个个生动形象，这也是本作品的魅力之一。

故事讲述了宇宙开发中心的上空发现了来历不明的太空船，中心继而受到两只怪兽的袭击。高斯奥特曼及时出现，但怪兽极其顽强，高斯几乎招架不住，幸得春野武藏相助，二人融为一体后，威力大增，而正当怪兽快被击退之际，另一个奥特曼杰斯提斯忽然出现。他竟然出手阻止高斯保护地球，最后竟令高斯及武藏死于怪兽之手。太空船的目的到底是什么？

联邦探员柴克（罗素克洛）介入了美国黑帮和日本山口组的恩怨中，儿子被绑，柴克与之进行生死较量。 也许，他不该接受这次绝命的任务…… 　 柴克是个单身父亲，并且是一位特别控员。他接任的每一件案子都是极度机密的。原本春风得意的他因妻子的过世让他陷入了人生与事业的低潮。由于FBI的一再请求，柴克决定再度复出。然而这次的任务是一项绝命任务，一旦复出行动便没有回头的余地和可能。在这次行动中，柴克必须先训练一位新的女探员与他搭挡来执行各项计划。当他们开始行动的时候，真正的危机也尾随而至，也使得柴克感到困惑，是否继续下去，还是中止任务。就在这个时候，FBI又有新的计划要柴克去进行……