《变异九头蛇》的故事开始于一间隐秘的生物基因实验室，女研究员带着九头蛇的基因序列逃离实验室，在鸣岭山的一片原始森林里培育出了怪兽九头蛇！为了获取九号生长激素，她用九头蛇的鳞片设下圈套，引来了陈教授和未婚夫，不明真相的陈教授一行人陷入了一个又一个圈套之中！片子最大的亮点就是情节不断反转，走进原始森林的每个人都隐藏着自己的真实目的，正义和邪恶势力对决，一场杀戮拉开帷幕！九头蛇似乎是影片的主角，却又沦为了险恶之人的杀人工具，曾经相爱的两个人因为不同的人生追求变成了最大仇家！而陈教授与女主的未婚夫小白之间也产生了种种猜忌，到底是谁偷走了九号生长激素，又是谁潜伏在队伍当中带领大家一步步陷入迷局？

特警吴惧为给在因禁毒牺牲的战友报仇，加入卧底行动。他接近前毒枭齐泰之子齐天，顺利和齐天成为好友。 齐天认为齐泰曾经的手下，毒枭万炎斌害死了自己父亲，一心报仇。吴惧帮助齐天躲过万炎斌的不断针对和追杀，并调查到万炎斌身后还有一名叫博士的毒枭才是毒贩集团的真正灵魂。吴惧的优秀表现引来博士注意，他和齐天加入博士集团，吴惧功劳卓著获得博士信任，却引来禁毒队长安宁的误解和针对。然而一次行动中安宁被毒贩绑架，吴惧为救安宁暴露警察身份，两人相爱，吴惧则发现博士竟然是著名企业家林嘉裕，而齐天查到当初父亲的死是林嘉裕和万炎斌联手所为，他利用齐泰遗留的毒品配方勾结境外贩毒势力，杀死万炎斌，对付林嘉裕，掀起腥风血雨，还和吴惧反目成仇。最终吴惧和安宁并肩作战，成功将毒贩消灭，并揪出警方内部叛徒，成功完成任务。