科学鉴证抽丝剥茧，悬疑奇案逐一侦破。聂宝言（陈慧珊）继承父遗志，加入法医官行列。其姐宝意（陈美琪）乃著名专栏作家兼电台节目主持，专替人解决家庭及爱情纠纷，惜能医不自医，与女儿津津（钟丽淇）关系恶劣。津认识了在法证科工作的曾家乔（鲁文杰），知他暗恋女CID蔡小棠（李珊珊），遂助他追求，却发现棠心有所属。后乔涉嫌谋杀旧女友咏妮（陈彦行），津深信乔无辜，遂与言及兄

女法医聂宝言（陈慧珊）上集黯然与督察曾家原（林保怡）分手后离港，终因姐聂宝意（陈美琪）结婚而返港并复职。宝言、家言二人重遇，但因宝言看穿小棠（李珊珊）对家原仍未忘情，遂有所保留。 　　小棠为成全二人，假意和宝言下属杨志伦（刘恺威）扮作情侣，宝言、家原终复合。 另一方面，聂津津（钟丽淇）因觉曾家乔（鲁文杰）性格不合而提出分手，性格不合而提出分手，辗转与男模特儿袁天明（海俊杰）展开恋情，家乔无奈之余，迁怒袁天明妹妹袁天晴（陈采岚），二人终日斗法，成斗气冤家。 　　宝言、家原合力侦破不少案件，感情更见一日千里。当二人得悉小棠和志伦只是伪装时，决定撮合她与有为律师王英杰（蔡子健），却不知令她堕入了死亡陷阱。

叶孝勤、叶孝礼两兄弟自大陆偷渡来港，决心在地产建筑业发展。二人勤奋好学，从低做起，适逢一宗烂尾工程，自组小型建筑公司接手，工程完成，为两兄弟带来希望。而勤妻亦在此时诞下第一个儿子叶荣添。二人生意越做越顺，可是当有利益关系时，冲突便随之而来。礼不甘心只当小承建商，狠下决心，设计将勤逐出股权，自己则继续壮大，终成为一代地产界巨子。勤被亲弟出卖，受到严重打击，无心再恋战，令家道中落。历史是循环不息的演进，叶孝勤、叶孝礼兄弟的故事，直接影响了下一代，特别是勤在顺景时诞下的叶荣添。

屠龙宝刀与倚天剑的出现，引发了江湖上的争夺战，武林各派为之生死相斗，死伤无数。虽然正邪势不两立，然而这场刀剑之争却造就了几段正邪之间的姻缘和孽缘。武当五侠张翠山与天鹰教妖女殷素素，因争夺屠龙刀而认识，并且情深爱切。但天意弄人，他们两人的结合，最后竟落得自尽赎罪、殉夫而亡的悲剧收场。 何谓正，何谓邪，不在身份，而在人心。阴差阳错，身为正派后人张翠山之子张无忌，被迫担任起邪教教主一职，并一生致力打破正邪的隔膜。无忌生性优柔寡断，感情丰富，因而纠缠于峨嵋派周芷若与蒙古郡主赵敏的三角感情中。周芷若出身正派，却因爱成恨，由正入邪；相反，被视为魔女并处处与武林做对的赵敏，竟受爱情的感化而弃邪从善，甘愿为忌放弃一生尊荣，相伴到天涯……

杨康的儿子杨过（古天乐 饰）自小被郭靖收养，郭靖希望他学好，于是送到了桃花岛跟黄药诗学习。杨过在桃花岛上整日被郭芙和大、小武欺负，一气之下独自出走了。杨过被古墓派的小龙女（李若彤 饰）收留，认她作姑姑，生活在活死人墓里跟小龙女学习武功，日久天长，两人渐渐互生情愫，决定今生今世结成夫妻，永远生活在古墓。可惜机缘巧合下，他们最终要走出活死人墓，去经历一番江湖恩怨，两人最后能否有情人终成眷属？