苏教授意外被困梦舟世界，只有帮助各朝代的玩家完成使命，找到源代码才能救出被困的苏教授。苏琳娜为了救出父亲与扭扭01、乐乐熊一起来到周朝，帮助周朝玩家克服困难，完成了梦舟任务，得到了有源代码的龙钟。

苏教授为了逃脱梦舟世界强行修改程序，导致了世界异变。为了尽快救出老爸，苏琳娜来到了秦时代，找到了玩家欧大勇。在苏琳娜的帮助下，欧大勇克服困难，最终完成了自己铸秦剑的使命，而苏琳娜又踏上了新的冒险之旅。

太空隧道在人工智能“星空”的操控下帮助着阳光城阳高速发展，然而突如其来的粒子风暴让“星空”脱离了人类控制。机甲怪物从隧道蜂拥而来，对地下不其城的“地球之源”发动攻击，动车人无意中帮助人类击退了机甲怪物的首次袭击。人类天才少年跳跳和郭文倩意识到机甲怪物是冲着地球之源而来。动车人决定和人类合作抗击共同的敌人外星怪物掠夺，以大复为队长的动车侠应运而生。在不断的冲突中，动车人不断地升级抵抗着掠夺的一次次袭击。掠夺吸收足够的地球之源化身成巨型堡垒发起最后决战，大复把自我情感移植到掠夺体内，掠夺体内的记忆被唤醒，并重新分离为亿万个量子个体。动车侠和人类取得最终的胜利。

本季延续第二季的小猪班纳故事，班纳和他的伙伴们仍然在星幻岛上快乐地生活，但是各种麻烦还是不断。因为呼噜大王的卧底双双、冒冒和失失在星幻岛上的破坏计划每次都会被班纳无意的破坏，所以一直没有进展，气急败坏的呼噜大王决定亲自出马，而呼噜大王的真身其实只是一个矮小的小丑，由于内心自卑，所以一直以来都是以威猛高大的机器外表面对手下，无奈之下，他只得撒谎说，去到星幻岛的小丑只是他的另外一个手下，而这反倒使得双双等人对小丑产生芥蒂，一心想着要破坏小丑的计划，在呼噜大王面前争宠。于是，即使小丑每次都会得到自己的干爹（住在月亮上的神秘人）的神力帮助，但计划仍是困难重重，更让他不爽的是，屡屡的失败跟班纳也不无关系，这让小丑更加将矛头直指班纳，消除星幻岛快乐的行动几乎成了消除班纳快乐的行动。一场三方明枪暗战，互相拆台的好戏就此上演，笑料百出，惊喜不断。

家喻户晓的神话人物孙悟空将会在这一部动画系列剧中化身为“齐小天”，一个着迷于《西游记》古老传说的少年，他梦想着能成为和孙悟空一样伟大的神话英雄。一个偶然的机会，他在山顶发现了金箍棒——很久以前，为了将牛魔王永久封禁在山中，孙悟空曾把它插在山顶作为封印。由于金箍棒被拔出而封印解除，牛魔王得以重返人间作恶，而齐小天必须踏上一段充满艰难险阻的征程，在与恶魔的战斗中重新塑造自我，成为新一代神话英雄。