在美国宇航局(NASA)科学家的帮助下，摄制组前往太平洋和大西洋几万英尺的海洋深处，去挖掘和发现那里所隐藏着的无穷无尽的奥秘。一直深入到海底，这就是一个产生异形的世界。这里没有阳光，海底火山的岩浆喷口使得地表是沸腾灼热。正是这样特殊的环境创造了许多最稀奇古怪的水下生灵，比如有种6英尺长的虫子，身上布满了红色的血管，可是它却没有消化器官；全盲的白色螃蟹和短脚的蜂窝虾有着不可思议的本领，它们凭感觉就可以辨别正确的方位去取暖和觅食。这些深海异形所生存的封闭环境和地球上其他物种的非独立生态系统完全不同。它们使卡梅隆产生这样的联想：这种生命的形式还会存在于外太空吗？ 卡梅隆与NASA的科学家、海洋生物学家们所经历的奇妙海底探险不仅拜访了深海异形，而且还对人类未来探索外太空提出了伟大的假设。

伊诺（亨瑞·霍珀 饰）是一个有点奇怪的年轻人，他似乎对生活毫无兴趣，却喜欢在陌生人的葬礼上游荡。在一次葬礼期间，他偶然邂逅了一位独特的女孩安娜贝尔（米娅·华希科沃斯卡 饰），两人渐渐成为无话不说的好朋友。伊诺向安娜贝尔介绍自己的一个鬼魂朋友浩（加濑亮 饰），安娜贝尔则与伊诺分享她为之痴迷的达尔文学说。然而好景不长，就在两人关系日渐亲密，生活的乐趣也慢慢复苏之时，安娜贝尔告诉了伊诺一个事实——她是一个将不久于世的癌症病人。面对着一边是难以割舍的韶华时光，一边是无法改写的死之永夜，这段不寻常的爱情将以怎样的方式对抗生命的流逝……

1990年，一艘巨大的飞船出现在地球上空，人们惶恐不安，却又分外好奇。经过一段时间紧张的等待，外星飞船始终没有动静。人类终于小心翼翼靠近它，强行走进舱内，结果发现了不计其数的外星人。他们形容丑陋，宛如虾子，而且健康状况极差，虚弱无力。原来这是一群来自外星的难民，他们最终被地球人接纳，并隔离在南非约翰内斯堡的一片区域内生活，此地名为“第九区”。经过长达20年的繁衍，外星难民的数量扩张至180万之多，且和周边人类的矛盾冲突不断，越来越多的人类呼吁将“大虾”赶出地球。 MNU（列国同盟组织）经过磋商，决定将外星难民迁移到更为偏远的区域。MNU外星事务部门的特工维库斯（Sharlto Copley 饰）专门负责搬迁工作。维库斯在动员过程中傲慢随意，与当地居民冲突频频。最终，他为自己的行为付出代价，外星人的神秘流体将其感染，维库斯慢慢变成了外星人的模样……

实习生们所在的云顶康乐园，是一座民办精神疗养医院，几人在医院实习的过程中，渐渐融入医院，了解到精神疾病患者的内心，也慢慢发现医院居然埋藏着的巨大的危机，背后有着说不清的利害关系，这群年轻人该怎么办？何去何从？

椿消失无踪后，重新回归的平稳日常也才没有过多久——突然，落下了不合时节的大雪。思考着这异常气象是否与吸血鬼有关的真昼，为了召集吸血鬼的主人们而联系了“色欲”的主人有栖院御园。然而，却得到了御园并不能自由行动的回复。在这之后也再也联络不上御园了。真昼他们担心着御园，到有栖院家寻找答案。——有栖院家所掩盖着的过去、被封印的御园的记忆，即将解开。