少林寺数百年来弘扬大业，发展武功，曾为太平盛世立下不朽功勋。清廷为打压异己，控制人民，借助少林叛徒石少锋（田俊 饰）等人围攻少林，致使少林弟子流落各地。少林大智禅师得意弟子云飞（谭道良 饰）功夫学成，奉师命下山保护反清义士并清理少林门户。云飞于路得谭小弟（成龙 饰）帮助混入石少锋所在白石镇。恰逢众义士搭救一少林子弟，不幸石少锋一伙早有准备，石之左膀右臂杜清（洪金宝 饰）将众义士杀伤无数。云飞接近杜清，假意投靠石少锋一伙，不料被石看破，身陷缧绁，谭小弟再次出面将云飞救出。原来谭小弟之兄长正是被石少锋害死，二人决计合力诛杀石，随即邀请因石少锋而失手害死自己心爱女子的剑术高手江南浪子加入己方……

舂米六心性聪颖多计，少年时因叔父被满洲人淩辱而死，誓为叔报仇，得三德和尚带入少林寺作俗家子弟习武多年，深得师父静尘看重。春急欲下山复仇，惟知木人巷难闯，乃决意偷下山，静尘着徒谢亚福追赶，以惩其违，福以己与春多年同门习武，略作轻惩，放之下山。憨直粗犷之牛精良在羊城内一染布场做机房工人，牛有妹生得如花貌美。羊城内有一爱罗王府乃满洲人，其弟白安福仗兄权势横行。白因垂涎牛妹美色，伺机将牛妹抢至一烂屋奸污，事后牛妹羞愤，以利剪自尽，牛得邻妇告奸妹者是满洲人所为，牛誓杀旗人为妹复仇……

一腔热血、正义感十足的夏令正曾经目睹恩师光天化日之下被人残忍杀害的血腥一幕，而他不为所惧，愈加坚定了主持正义、惩恶扬善的信念。

一介贫民仁杰（刘家辉）为惩罚平时靠鱼肉百姓过日子的恶霸高峰（王龙威），假扮三德和尚对其展开攻势，不想被对方识破反遭一顿痛殴。其后，仁杰来到少林寺请求三德和尚传授功夫，但不被对方作正眼旁观。 有感于仁杰的诚心，三德和尚最终允许他留在少林寺，但不教授功夫，只让他负责搭棚修葺的工作。仁杰在工作之余，不忘初来志愿，见缝插针恳求三德和尚收他为徒，终惹怒对方，在对方的示意下，仁杰明白搭棚亦是少林功夫的一种，从此刻苦学习。

方世玉（小侯）因与大清武馆高手（刘家良）结怨，其母苗翠花（李丽丽）为避冲突，暗带方上少林寺，求三德和尚（刘家辉）收其为俗家弟子；方入寺后自恃功夫了得频频闯祸，终被三德逐出。奸人提督（白彪）乘势诱方邀同房九杰离寺，暗图一网打尽；十杰失踪，三德心知有异，遂约苗同往督府对付旗兵……