经过二十七周警校训练，立文与柏翘等一众学警终于passing out了。两位新扎师兄被派到油麻地分区同一小队，成为真正的警员。柏翘希望可以尽快成为督察，以报答亡父及好好照顾外祖父。为了可以尽快升职，柏翘严守警察通例，样样按本子办事，不求有功但求无过。立文因为性格远比柏翘来得冲动，对一个好警察的定义也不同，所以处事方法亦有别。 　　一次柏翘巡逻时截查一班蛊惑仔，结果因为经验不足，被蛊惑仔头目景峰戏弄到不知如何是好，结果事后还被景峰的手下傻强投诉，令柏翘要接受警方内部调查。柏翘为此耿耿于怀，怕事件已纪录在案，影向晋升前途。 　　一次落更后，霭琳与立文刚巧遇到景峰、傻强等人形迹可疑，就拉着立文跟踪景峰等，希望发现景峰傻强之罪证。时柏翘正在当值，发现二人行动，但立文去到已是太迟，只见霭琳被傻强以枪击毙倒卧地上… 　　目睹霭琳中枪身亡，柏翘大受打击，一时间对发生的事感到混乱无法接受。柏翘忍无可忍向立文爆发，认为立文要为霭琳之死负上全责，因柏翘觉得因为立文心红想破案所以才会带同霭琳去追查景峰等人，二人间已暗暗产生了芥蒂。 　　半年后，立文与柏翘仍然是油麻地分区的军装警员，始知原来半年前柏翘立文遇到的景峰正担任卧底，现已立了大功所以升任为沙展，并调到二人环头的军装巡逻小队，成为二人的上司。 　　通常一般警员要做了军装小队巡逻警员一年以上，才会被选中入机动部队受训成为“蓝帽子”，但柏翘在半年后就向上司自荐要入营，因为入机动部队是警员晋升一个必备的条件。而景峰因为新升任沙展，亦需要入机动部队从新接受训练。 　　三人需要面对为期十二周的严格训练。立文与柏翘在小队中明争暗斗，以争夺机动部队最佳警员为目标。机动部队最讲求的就是团队精神，立文、柏翘的明争暗斗令到小队的表现大受影响，教景峰大为头痛。景峰亦不忍见到两兄弟重蹈当日自己跟李sir的覆辙，为令二人和好，向柏翘讲出当日并不是立文冲动所以累死霭琳… 　　后来机动部队参与了一次世贸的行动，示威不单冲破了机动部队的防线，亦令这对曾经反目的好朋友明白大家的友情是如何珍贵。终于，这次世贸行动不单令二人和好，还令二人变成更有默契、关系更紧密的好兄弟。 　　正当三人成为合作无间的机动部队小队时，柏翘开始不断浮现霭琳死时的一幕，心理辅导医生让柏翘记起当日霭琳死的真相，柏翘竟不知如何面对…

贺俊看准因受贿入狱的前狱长邓瀚宗对监狱的熟悉，引诱他合作逃狱。二人一拍即合，更决定杀害刀疤再嫁祸滚筒，以免重蹈失败的覆辙，但过程中贺俊发现邓瀚宗另有诡计，迫使他倒戈与建天和新狱长张源合作，破解邓瀚宗的阴谋。

1997年回归前夕，多方势力矛盾激化，暴力事件频发。 　　巨变当前，黑帮龙头林耀昌（任达华 饰）对亲信阿骆（任贤齐 饰）委以帮派重任。多重身份的阿骆在黑白边缘行走，一场除暴行动正悄然掀开反杀的序幕。

清末，青城县洛水村。秦月香为保护女儿采青误杀桑老三，被知县萧汝章利用，将月香的旧主子、采青生父青城富商沈渊卷入是非漩涡。润雪陪采青执月香血书投奔沈渊，被沈渊妻玉茹扣押信物，采青、润雪入沈府当丫环，与大小姐沈流云、二少爷沈流年一同长大，流云处处刁难采青，而流年却对采青情愫暗生，时时维护。

雨夜，香港法医中心遭遇一伙训练有素的悍匪的洗劫。来者挟持陈嘉豪（张家辉 饰）乔琳（杨紫 饰）两位法医，逼迫他们寻找一具特殊尸体并找出尸体体内的一颗子弹。法医在解剖的过程中发现，子弹事关一场黑帮血拼的大案，而匪首SANTA（任贤齐 饰）的身份也另有蹊跷。为了保护证物揭开真相，手无寸铁的陈嘉豪乔琳，利用身边一切可以利用的器械，和法医中心的特殊地势进行布局反击。逐渐被激怒的匪徒越发狂躁嗜血，陷入绝境的法医们，无畏楼毁人亡的危机，决心硬刚到底！